2007年，香港中文大学深圳研究院正式成立。作为香港院校最早在内地设立的研究机构之一，深圳研究院自建院起就成为内地和香港两地沟通的桥梁，与大学以及粤港澳大湾区的发展有着密不可分的关系。深圳研究院贯彻大学“结合传统与现代，融会中国与西方”的使命，求真务实、开拓创新，不断在产学研方向上深耕，同时，以客观、主动、支持、合作的理念，助力大学、校友以及各方合作伙伴，在科研提升、人才培育、技术转移和创新发展方面进行深入合作。作为广东省新型研发机构，深圳研究院开展了卓有成效的工作，包括建立国家重点实验室深圳基地、深圳市重点实验室、深圳市工程实验室在内的超过30个研发平台，共承担超过500多项国家、省、市科研项目，100多项产业合作项目，发表超过2900篇论文，申请超过90项专利。从2018年起，研究院成立众创中心，作为企业孵化平台，目前已经成为科技部火炬中心、广东省、深圳市认定的众创空间，在短短的4年期间，共孵化近80家由香港中文大学教授、学生及校友创立的企业，其中6家已经发展成为国家高新技术企业，15家成为科技型中小企业。
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